Molekulardynamik
Prof. Martin Zacharias
Forschungsgebiet
Die Funktion von Proteinen und Nukleinsäuren in lebenden Zellen wird durch ihre molekulare Dynamik bestimmt. Am Lehrstuhl „Molekulardynamik“ werden Computersimulationsmethoden eingesetzt, um die Struktur, Funktion und Dynamik von Biomolekülen zu untersuchen. Zu unseren Zielen zählt dabei ein genaueres Verständnis von Strukturbildungsprozessen und die Entschlüsselung des Mechanismus der Assoziation von Biomolekülen. Moleküldynamiksimulationen basierend auf einem klassischen Kraftfeld bilden unsere wichtigste Methode, um die Molekülbewegung in atomarem Detail zu verfolgen. Die Simulationen erlauben es uns, thermodynamische und kinetische Moleküleigenschaften mit Methoden der statistischen Mechanik zu analysieren. Wir entwickeln darüber hinaus auch Verfahren, um die Bindung von Liganden an Biomoleküle vorherzusagen.
Adresse/Kontakt
Ernst-Otto-Fischer-Straße 8/I
85748 Garching b. München
+49 89 289 12393
Fax: +49 89 289 12444
Mitarbeiterinnen und Mitarbeiter der Arbeitsgruppe
Professor
Photo | Akad. Grad | Vorname | Nachname | Raum | Telefon | |
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Prof. Dr. | Martin | Zacharias | 046 | +49 89 289-12335 |
Sekretariat
Photo | Akad. Grad | Vorname | Nachname | Raum | Telefon | |
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Sonja | Ortner | 047 | +49 89 289-12393 |
Wissenschaftlerinnen und Wissenschaftler
Photo | Akad. Grad | Vorname | Nachname | Raum | Telefon | |
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M.Sc. | Shu-Yu | Chen | 042 | +49 89 289-12564 | ||
M.Sc. | Maximilian | Kienlein | 044 | +49 89 289-12730 | ||
Brianda | Lopez Santini | 045 | +49 89 289-12731 | |||
Dr. | Patrick | Quoika | 048 | +49 89 289-13766 | ||
Dr. | Maria | Reif | 045 | +49 89 289-12731 | ||
M.Sc. | Carlos Christian | Sustay Martinez | 040 | +49 89 289-51612 | ||
M.Sc. | Luis | Vollmers | 044 | +49 89 289-12730 | ||
M.Sc. | Paul | Westphälinger | 044 | +49 89 289-12730 | ||
Dr. | Gabriel | Zoldak | 130 | – | ||
M.Sc. | Richard | Zschau | 042 | +49 89 289-12564 |
Studierende
Photo | Akad. Grad | Vorname | Nachname | Raum | Telefon | |
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B.Sc. | Maximilian | Block | – | – | ||
Asha | Knipp | – | – | |||
B.Sc. | Pawel | Korzeb | – | – | ||
B.Sc. | Mira Tanja | Mahlein | – | – | ||
B.Sc. | Yasmin | Saremi Nanji | – | – | ||
Luis Jakob | Walter | – | – | |||
Ziyi | Wang | – | – | |||
Andere Mitarbeiterinnen und Mitarbeiter
Photo | Akad. Grad | Vorname | Nachname | Raum | Telefon | |
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Dr. | Jonathan | Coles | 048 | – | ||
Susmita | De | – | – | |||
M.Sc. | Christina | Frost | – | – | ||
Margrethe | Gaardlos | – | – | |||
Ameya | Harmalkar | – | – | |||
M.Sc. | Julian | Hartmann | 701 | – | ||
Dr. | Manuel | Hitzenberger | 048 | +49 89 289-13766 | ||
Dr. | Korbinian | Liebl | – | +49 89 289-13697 | ||
Anshuman J. | Mahapatra | – | – | |||
M.Sc. | Danial | Pour Jafar Dehkordi | 059 | – | ||
B.Sc. | Arrien Symon | Rauh | – | – | ||
Jose | Roldan | – | – | |||
Prof. Dr. | Philipp | Scherer | 073 | – | ||
Neelanjana | Sengupta | – | – | |||
Till | Siebenmorgen | 059 | – |
Lehrangebot der Arbeitsgruppe
Lehrveranstaltungen mit Beteiligung der Arbeitsgruppe
Abgeschlossene und laufende Abschlussarbeiten an der Arbeitsgruppe
- DNA Stability Estimations by Alchemical Free Energy Simulations
- Abschlussarbeit im Bachelorstudiengang Physik
- Themensteller(in): Martin Zacharias
- Mechanism of Protein-DNA and Protein-Peptide Binding Studied Using Advanced Sampling Simulations
- Abschlussarbeit im Masterstudiengang Physik (Biophysik)
- Themensteller(in): Martin Zacharias
- Molecular Dynamics Study of Substrate Processing by gamma-secretase
- Abschlussarbeit im Masterstudiengang Physics (Applied and Engineering Physics)
- Themensteller(in): Martin Zacharias
- Study of Biomolecule Folding and Binding Using Molecular Dynamics and Markov State Modeling
- Abschlussarbeit im Masterstudiengang Physik (Biophysik)
- Themensteller(in): Martin Zacharias
- Prediction of the binding geometry of a membrane protein complex
- Abschlussarbeit im Bachelorstudiengang Physik
- Themensteller(in): Martin Zacharias