Prof. Dr. rer. nat. Friedrich Simmel

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Arbeitsgruppe
Bionanotechnologie und Bioelektronik
Funktion
Professur für Bionanotechnologie und Bioelektronik

Lehrveranstaltungen und Termine

Titel und Modulzuordnung
ArtSWSDozent(en)Termine
Experimentalphysik 1 für Chemiker
Zuordnung zu Modulen:
VU 3 Simmel, F.
Mitwirkende: Pirzer, T.
Montag, 17:00–19:00
sowie Termine in Gruppen
Synthetische Biologie 1
Zuordnung zu Modulen:
VO 2 Simmel, F. Donnerstag, 10:00–12:00
Seminar zu aktuellen Problemen der Bionanophysik
Zuordnung zu Modulen:
HS 2 Simmel, F. Montag, 11:00–12:30
Aktuelle Forschung in der Synthetischen Biologie
Zuordnung zu Modulen:
SE 2 Simmel, F.
Biomolecular Systems
Zuordnung zu Modulen:
SE 2 Gerland, U. Simmel, F. Zaccone, A. Zacharias, M. Donnerstag, 12:00–13:30
sowie einzelne oder verschobene Termine
FOPRA-Versuch 71: Peptid-Poren
Zuordnung zu Modulen:
PR 1 Simmel, F.
Mitwirkende: Krishnan, S.
FOPRA-Versuch 87: Rasterkraftmikroskopie und oberflächenunterstützte Selbstassemblierung von DNA-Nanostrukturen
Zuordnung zu Modulen:
PR 1 Simmel, F.
Mitwirkende: Vogele, K.Ziegler, D.
Praktikum Biophysik für Studenten der Biochemie
Zuordnung zu Modulen:
PR 4 Bausch, A. Dietz, H. Lieleg, O. Rief, M. Simmel, F. … (insgesamt 7) Mittwoch, 08:00–13:00
Mittwoch, 08:00–13:00
sowie einzelne oder verschobene Termine

Ausgeschriebene Angebote für Abschlussarbeiten

Biochemisches Parameter-Screening mit Tröpfchenmikrofluidik

In this project we aim at screening the parameter space of biochemical circuits using droplet microfluidics. For instance, the dependence of simple biochemical reactions and reaction networks on the concentrations of key components will be investigated by mixing different compositions on a microfluidic chip and encapsulating them into microdroplets. This allows to make thousands of experiments in parallel and thus capture the phase space of these reactions in only a few experiments.

geeignet als
  • Bachelorarbeit Physik
Themensteller(in): Friedrich Simmel
In vitro-Replikation von Plasmiden

For a self-replicating artificial cell, a growing membrane boundary is necessary as well as a system which stores and replicates genetic information. Bacteria store information in the chromosome, but also in extrachromosomal units called "plasmids", which have their own replication machinery. In this project we aim at the investigation of various plasmid replication mechanisms in a cell free bacterial extract.

geeignet als
  • Bachelorarbeit Physik
Themensteller(in): Friedrich Simmel
Kinetik von RNA-Strangverdrängungsreaktionen

Single-stranded nucleic acid molecules can invade double-stranded species in a process called "strand displacement", in which the invading strand binds to one of the two strands constituting the duplex, thereby displacing the other strand. This process is at the core of many schemes for DNA computation, but also gene regulatory mechanisms. Due to the different nature of RNA compared to the DNA double helix, a distinct kinetic behavior has been predicted for RNA, but not experimentally tested so far. We will here study the process in simple experiments, in which RNA molecules invade functional RNA structures such as RNA aptamers or riboswitches by this mechanism.

geeignet als
  • Bachelorarbeit Physik
Themensteller(in): Friedrich Simmel

Kondensierte Materie

Wenn Atome sich zusammen tun, wird es interessant: Grundlagenforschung an Festkörperelementen, Nanostrukturen und neuen Materialien mit überraschenden Eigenschaften treffen auf innovative Anwendungen.

Kern-, Teilchen-, Astrophysik

Ziel der Forschung ist das Verständnis unserer Welt auf subatomarem Niveau, von den Atomkernen im Zentrum der Atome bis hin zu den elementarsten Bausteinen unserer Welt.

Biophysik

Biologische Systeme, vom Protein bis hin zu lebenden Zellen und deren Verbänden, gehorchen physikalischen Prinzipien. Unser Forschungsbereich Biophysik ist deutschlandweit einer der größten Zusammenschlüsse in diesem Bereich.