Bionanotechnologie und Bioelektronik

Prof. Friedrich Simmel

Forschungsgebiet

Our goal is the realization of self-organizing molecular systems that are able to respond to their environment, compute, move, take action.

Adresse/Kontakt

Am Coulombwall 4a/II
85748 Garching b. München
sekretariate14@ph.tum.de
+49 89 289 11610
Fax: +49 89 289 11612

Mitarbeiterinnen und Mitarbeiter der Arbeitsgruppe

Professorinnen und Professoren

Mitarbeiterinnen und Mitarbeiter

Lehrangebot der Arbeitsgruppe

Lehrveranstaltungen mit Beteiligung der Arbeitsgruppe

Ausgeschriebene Angebote für Abschlussarbeiten an der Arbeitsgruppe

Biochemisches Parameter-Screening mit Tröpfchenmikrofluidik

In this project we aim at screening the parameter space of biochemical circuits using droplet microfluidics. For instance, the dependence of simple biochemical reactions and reaction networks on the concentrations of key components will be investigated by mixing different compositions on a microfluidic chip and encapsulating them into microdroplets. This allows to make thousands of experiments in parallel and thus capture the phase space of these reactions in only a few experiments.

geeignet als
  • Bachelorarbeit Physik
Themensteller(in): Friedrich Simmel
In vitro-Replikation von Plasmiden

For a self-replicating artificial cell, a growing membrane boundary is necessary as well as a system which stores and replicates genetic information. Bacteria store information in the chromosome, but also in extrachromosomal units called "plasmids", which have their own replication machinery. In this project we aim at the investigation of various plasmid replication mechanisms in a cell free bacterial extract.

geeignet als
  • Bachelorarbeit Physik
Themensteller(in): Friedrich Simmel
Kinetik von RNA-Strangverdrängungsreaktionen

Single-stranded nucleic acid molecules can invade double-stranded species in a process called "strand displacement", in which the invading strand binds to one of the two strands constituting the duplex, thereby displacing the other strand. This process is at the core of many schemes for DNA computation, but also gene regulatory mechanisms. Due to the different nature of RNA compared to the DNA double helix, a distinct kinetic behavior has been predicted for RNA, but not experimentally tested so far. We will here study the process in simple experiments, in which RNA molecules invade functional RNA structures such as RNA aptamers or riboswitches by this mechanism.

geeignet als
  • Bachelorarbeit Physik
Themensteller(in): Friedrich Simmel

Abgeschlossene und laufende Abschlussarbeiten an der Arbeitsgruppe

Charakterisierung und Translokation von Makromolekülen mittels künstlichen Nanoporen
Abschlussarbeit im Masterstudiengang Physik (Biophysik)
Themensteller(in): Friedrich Simmel
Engineering of Artificial Cellular Communities Using Droplet Microfluidics
Abschlussarbeit im Masterstudiengang Physik (Biophysik)
Themensteller(in): Friedrich Simmel
Signal Propagation along Cardiac Bio-Cables Guided by 3D-Printed Microstructures
Abschlussarbeit im Masterstudiengang Physik (Biophysik)
Themensteller(in): Friedrich Simmel

Biophysik

Biologische Systeme, vom Protein bis hin zu lebenden Zellen und deren Verbänden, gehorchen physikalischen Prinzipien. Unser Forschungsbereich Biophysik ist deutschlandweit einer der größten Zusammenschlüsse in diesem Bereich.