Molekulardynamik
Prof. Martin Zacharias
Forschungsgebiet
Die Funktion von Proteinen und Nukleinsäuren in lebenden Zellen wird durch ihre molekulare Dynamik bestimmt. Am Lehrstuhl „Molekulardynamik“ werden Computersimulationsmethoden eingesetzt, um die Struktur, Funktion und Dynamik von Biomolekülen zu untersuchen. Zu unseren Zielen zählt dabei ein genaueres Verständnis von Strukturbildungsprozessen und die Entschlüsselung des Mechanismus der Assoziation von Biomolekülen. Moleküldynamiksimulationen basierend auf einem klassischen Kraftfeld bilden unsere wichtigste Methode, um die Molekülbewegung in atomarem Detail zu verfolgen. Die Simulationen erlauben es uns, thermodynamische und kinetische Moleküleigenschaften mit Methoden der statistischen Mechanik zu analysieren. Wir entwickeln darüber hinaus auch Verfahren, um die Bindung von Liganden an Biomoleküle vorherzusagen.
Adresse/Kontakt
Ernst-Otto-Fischer-Straße 8/I
85748 Garching b. München
+49 89 289 12393
Fax: +49 89 289 12444
Mitarbeiterinnen und Mitarbeiter der Arbeitsgruppe
Professor
Photo | Akad. Grad | Vorname | Nachname | Raum | Telefon | |
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Prof. Dr. | Martin | Zacharias | 046 | +49 89 289-12335 |
Sekretariat
Photo | Akad. Grad | Vorname | Nachname | Raum | Telefon | |
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Sonja | Ortner | 047 | +49 89 289-12393 |
Wissenschaftlerinnen und Wissenschaftler
Photo | Akad. Grad | Vorname | Nachname | Raum | Telefon | |
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M.Sc. | Shu-Yu | Chen | 042 | +49 89 289-12564 | ||
M.Sc. | Maximilian | Kienlein | 044 | +49 89 289-12730 | ||
Brianda | Lopez Santini | 045 | +49 89 289-12731 | |||
Dr. | Patrick | Quoika | 048 | +49 89 289-13766 | ||
Dr. | Maria | Reif | 045 | +49 89 289-12731 | ||
M.Sc. | Carlos Christian | Sustay Martinez | 040 | +49 89 289-51612 | ||
M.Sc. | Luis | Vollmers | 044 | +49 89 289-12730 | ||
M.Sc. | Paul | Westphälinger | 044 | +49 89 289-12730 | ||
Dr. | Gabriel | Zoldak | 130 | – | ||
M.Sc. | Richard | Zschau | 042 | +49 89 289-12564 |
Studierende
Photo | Akad. Grad | Vorname | Nachname | Raum | Telefon | |
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B.Sc. | Maximilian | Block | – | – | ||
Asha | Knipp | – | – | |||
B.Sc. | Pawel | Korzeb | – | – | ||
B.Sc. | Mira Tanja | Mahlein | – | – | ||
B.Sc. | Yasmin | Saremi Nanji | – | – | ||
Luis Jakob | Walter | – | – | |||
Ziyi | Wang | – | – | |||
Andere Mitarbeiterinnen und Mitarbeiter
Photo | Akad. Grad | Vorname | Nachname | Raum | Telefon | |
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Dr. | Jonathan | Coles | 048 | – | ||
Susmita | De | – | – | |||
M.Sc. | Christina | Frost | – | – | ||
Margrethe | Gaardlos | – | – | |||
Ameya | Harmalkar | – | – | |||
M.Sc. | Julian | Hartmann | 701 | – | ||
Dr. | Manuel | Hitzenberger | 048 | +49 89 289-13766 | ||
Dr. | Korbinian | Liebl | – | +49 89 289-13697 | ||
Anshuman J. | Mahapatra | – | – | |||
M.Sc. | Danial | Pour Jafar Dehkordi | 059 | – | ||
B.Sc. | Arrien Symon | Rauh | – | – | ||
Jose | Roldan | – | – | |||
Prof. Dr. | Philipp | Scherer | 073 | – | ||
Neelanjana | Sengupta | – | – | |||
Till | Siebenmorgen | 059 | – |
Lehrangebot der Arbeitsgruppe
Lehrveranstaltungen mit Beteiligung der Arbeitsgruppe
Abgeschlossene und laufende Abschlussarbeiten an der Arbeitsgruppe
- The effect of mutations in the Translocator protein 18kDa (TSPO) on ligand binding studied with alchemical free-energy calculations
- Abschlussarbeit im Bachelorstudiengang Physik
- Themensteller(in): Martin Zacharias
- Binding free energy calculations of RNA kissing loops
- Abschlussarbeit im Masterstudiengang Physik (Biophysik)
- Themensteller(in): Martin Zacharias
- Computer Simulation of the Binding of Arginine-Rich Peptides to RNA
- Abschlussarbeit im Bachelorstudiengang Physik
- Themensteller(in): Martin Zacharias
- Modern methods for identification of drug like ligands for Protein protein interaction
- Abschlussarbeit im Masterstudiengang Physik (Biophysik)
- Themensteller(in): Martin Zacharias
- Studying amyloid deformability using MD simulations
- Abschlussarbeit im Masterstudiengang Physik (Biophysik)
- Themensteller(in): Martin Zacharias
- Stability of Collagen Fragments studied by Molecular Dynamics Simulations
- Abschlussarbeit im Bachelorstudiengang Physik
- Themensteller(in): Martin Zacharias
- Advanced sampling of protein-protein complexes
- Abschlussarbeit im Bachelorstudiengang Physik
- Themensteller(in): Martin Zacharias