Intensivkurs Proteomics
Proteomics Practical Course
Lehrveranstaltung 240790810 im WS 2018/9
Basisdaten
LV-Art | Übung |
---|---|
Umfang | 3 SWS |
betreuende Organisation | Lehrstuhl für Proteomik und Bioanalytik (Prof. Küster) |
Dozent(inn)en |
Christina Ludwig Guillaume Medard Chen Meng Mathias Wilhelm Stephanie Wilhelm Leitung/Koordination: Bernhard Küster |
Termine |
10 Termine in Gruppen |
Zuordnung zu Modulen
-
WZ2439: Proteomics: Analytische Grundlagen und Biomedizinische Anwendungen / Proteomics: Analytical Basics and Biomedical Applications
Dieses Modul ist in den folgenden Katalogen enthalten:- Fokussierungsrichtung Biosensorik im M.Sc. Biomedical Engineering and Medical Physics
weitere Informationen
Lehrveranstaltungen sind neben Prüfungen Bausteine von Modulen. Beachten Sie daher, dass Sie Informationen zu den Lehrinhalten und insbesondere zu Prüfungs- und Studienleistungen in der Regel nur auf Modulebene erhalten können (siehe Abschnitt "Zuordnung zu Modulen" oben).
ergänzende Hinweise | Die Teilnehmer dieser Übung erlernen Methoden und Auswerteverfahren für die massenspektrometrische Proteinidentifikation. Dazu werden unbekannte Proteinproben (auch Gemische) and die Teilnehmer ausgegeben. Die Protein werden mithilfe der SDS-PAGE getrennt. Gelbereiche werden ausgeschnitten und durch die Protease Trypsin im Gel in Peptide gespalten. Die so entstandenen Peptidgemische werden entweder nach Entsalzung direkt mittels der MALDI TOF-TOF Technik analysiert oder der Analyse durch HPLC gekoppelte ESI-MS/MS zugeführt. Die aus der MS Analytik gewonnenen Spektren werden auf verschiedene Weise analysiert, die alle die Identifikation der Proteine der Probe zum Ziel haben. 1. Peptide mass fingerprinting: hier werden lediglich die Peptidmassen zum Abgleich mit einer Proteinsequenzdatenbank herangezogen 2. Sequence tags: hier wird durch manuelle Spektreninterpretation eine Peptidteilsequenz interpretiert und die Kombination aus AS Sequenz und Masseninformationen zur Datenbanksuche verwendet. 3. Automatische Suchen: hier ueberlasst man dem Computer die Zuordnung von Spektrum zu Peptid zu Protein. Bei diesem Verfahren muessen daher Konfidenzkriterien erarbeitet werden nach denen eine objektive Entscheidung ueber die Richtigkeit der Proteinidentifikation getroffen werden kann. Bei allen obigen Inhalten gibt es einen intensiven Austausch zwischen Dozenten und Uebungsteilnehmern. |
---|---|
Links | TUMonline-Eintrag |
Gleiche Lehrveranstaltungen (z. B. in anderen Semestern)
Semester | Titel | Dozent(en) | Termine |
---|---|---|---|
WS 2023/4 | Proteomics Practical Course | Abele, M. Küster, B. Ludwig, C. Schneider, A. The, M. |
Mo, 09:00–17:00, EG L 12 Mo, 09:00–17:00, DG L 01 sowie Termine in Gruppen |
SS 2023 | Proteomics Practical Course | Küster, B. Ludwig, C. Schneider, A. The, M. Wilhelm, S. |
Mo, 09:00–17:00, DG L 01 Di, 09:00–17:00, DG L 01 Mo, 09:00–16:00, DG L 01 Mo, 09:00–16:00, EG L 12 |
WS 2022/3 | Proteomics Practical Course | Küster, B. Ludwig, C. Schneider, A. The, M. |
Mo, 09:00–17:00, EG L 12 Mo, 09:00–17:00, DG L 01 sowie Termine in Gruppen |
SS 2022 | Intensivkurs Proteomics | Küster, B. Ludwig, C. Meng, C. Wilhelm, S. |
Mo, 09:00–16:00, DG L 01 Mo, 09:00–16:00, EG L 12 sowie Termine in Gruppen |
WS 2021/2 | Intensivkurs Proteomics | Küster, B. Ludwig, C. Meng, C. Wilhelm, S. |
Mo, 09:00–17:00, EG L 12 Mo, 09:00–17:00, DG L 01 sowie Termine in Gruppen |
SS 2021 | Proteomics Practical Course | Küster, B. Ludwig, C. Meng, C. Wilhelm, S. |
Mo, 09:00–16:00, EG L 12 Di, 09:00–16:00, DG L 01 sowie einzelne oder verschobene Termine sowie Termine in Gruppen |
WS 2020/1 | Intensivkurs Proteomics | Küster, B. Ludwig, C. Wilhelm, M. Wilhelm, S. |
Mo, 09:00–17:00, DG L 01 Mo, 09:00–17:00, EG L 12 sowie Termine in Gruppen |
SS 2020 | Proteomics Practical Course |
Ludwig, C.
Medard, G.
Meng, C.
Wilhelm, M.
Wilhelm, S.
Leitung/Koordination: Küster, B. |
Mo, 09:00–16:00, EG L 12 Mo, 09:00–16:00, EG L 12 Do, 09:00–16:00, EG L 12 |
SS 2020 | Proteomics Practical Course |
Ludwig, C.
Medard, G.
Meng, C.
Wilhelm, M.
Wilhelm, S.
Leitung/Koordination: Küster, B. |
Do, 09:00–17:00, EG L 12 Fr, 09:00–17:00, EG L 12 |
WS 2019/20 | Intensivkurs Proteomics |
Ludwig, C.
Meng, C.
Wilhelm, M.
Wilhelm, S.
Leitung/Koordination: Küster, B. |
Mo, 09:00–16:00, EG L 12 |
SS 2019 | Proteomics Practical Course |
Ludwig, C.
Medard, G.
Meng, C.
Wilhelm, M.
Wilhelm, S.
Leitung/Koordination: Küster, B. |
Mo, 09:00–16:00, EG L 12 |
SS 2018 | Proteomics Practical Course | ||
WS 2017/8 | Intensivkurs Proteomics | ||
SS 2017 | Proteomics Practical Course | ||
WS 2016/7 | Intensivkurs Proteomics | ||
SS 2016 | Proteomics Practical Course | ||
WS 2015/6 | Intensivkurs Proteomics | ||
SS 2015 | Proteomics Practical Course | ||
WS 2014/5 | Intensivkurs Proteomics |