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Intensivkurs Proteomics
Proteomics Practical Course

Lehrveranstaltung 240790810 im WS 2018/9

Basisdaten

LV-Art Übung
Umfang 3 SWS
betreuende Organisation Lehrstuhl für Proteomik und Bioanalytik (Prof. Küster)
Dozent(inn)en Christina Ludwig
Guillaume Medard
Chen Meng
Mathias Wilhelm
Stephanie Wilhelm
Leitung/Koordination: Bernhard Küster
Termine 10 Termine in Gruppen

Zuordnung zu Modulen

weitere Informationen

Lehrveranstaltungen sind neben Prüfungen Bausteine von Modulen. Beachten Sie daher, dass Sie Informationen zu den Lehrinhalten und insbesondere zu Prüfungs- und Studienleistungen in der Regel nur auf Modulebene erhalten können (siehe Abschnitt "Zuordnung zu Modulen" oben).

ergänzende Hinweise Die Teilnehmer dieser Übung erlernen Methoden und Auswerteverfahren für die massenspektrometrische Proteinidentifikation. Dazu werden unbekannte Proteinproben (auch Gemische) and die Teilnehmer ausgegeben. Die Protein werden mithilfe der SDS-PAGE getrennt. Gelbereiche werden ausgeschnitten und durch die Protease Trypsin im Gel in Peptide gespalten. Die so entstandenen Peptidgemische werden entweder nach Entsalzung direkt mittels der MALDI TOF-TOF Technik analysiert oder der Analyse durch HPLC gekoppelte ESI-MS/MS zugeführt. Die aus der MS Analytik gewonnenen Spektren werden auf verschiedene Weise analysiert, die alle die Identifikation der Proteine der Probe zum Ziel haben. 1. Peptide mass fingerprinting: hier werden lediglich die Peptidmassen zum Abgleich mit einer Proteinsequenzdatenbank herangezogen 2. Sequence tags: hier wird durch manuelle Spektreninterpretation eine Peptidteilsequenz interpretiert und die Kombination aus AS Sequenz und Masseninformationen zur Datenbanksuche verwendet. 3. Automatische Suchen: hier ueberlasst man dem Computer die Zuordnung von Spektrum zu Peptid zu Protein. Bei diesem Verfahren muessen daher Konfidenzkriterien erarbeitet werden nach denen eine objektive Entscheidung ueber die Richtigkeit der Proteinidentifikation getroffen werden kann. Bei allen obigen Inhalten gibt es einen intensiven Austausch zwischen Dozenten und Uebungsteilnehmern.
Links TUMonline-Eintrag

Gleiche Lehrveranstaltungen (z. B. in anderen Semestern)

SemesterTitelDozent(en)Termine
WS 2023/4 Proteomics Practical Course Abele, M. Küster, B. Ludwig, C. Schneider, A. The, M. Mo, 09:00–17:00, EG L 12
Mo, 09:00–17:00, DG L 01
sowie Termine in Gruppen
SS 2023 Proteomics Practical Course Küster, B. Ludwig, C. Schneider, A. The, M. Wilhelm, S. Mo, 09:00–17:00, DG L 01
Di, 09:00–17:00, DG L 01
Mo, 09:00–16:00, DG L 01
Mo, 09:00–16:00, EG L 12
WS 2022/3 Proteomics Practical Course Küster, B. Ludwig, C. Schneider, A. The, M. Mo, 09:00–17:00, EG L 12
Mo, 09:00–17:00, DG L 01
sowie Termine in Gruppen
SS 2022 Intensivkurs Proteomics Küster, B. Ludwig, C. Meng, C. Wilhelm, S. Mo, 09:00–16:00, DG L 01
Mo, 09:00–16:00, EG L 12
sowie Termine in Gruppen
WS 2021/2 Intensivkurs Proteomics Küster, B. Ludwig, C. Meng, C. Wilhelm, S. Mo, 09:00–17:00, EG L 12
Mo, 09:00–17:00, DG L 01
sowie Termine in Gruppen
SS 2021 Proteomics Practical Course Küster, B. Ludwig, C. Meng, C. Wilhelm, S. Mo, 09:00–16:00, EG L 12
Di, 09:00–16:00, DG L 01
sowie einzelne oder verschobene Termine
sowie Termine in Gruppen
WS 2020/1 Intensivkurs Proteomics Küster, B. Ludwig, C. Wilhelm, M. Wilhelm, S. Mo, 09:00–17:00, DG L 01
Mo, 09:00–17:00, EG L 12
sowie Termine in Gruppen
SS 2020 Proteomics Practical Course Ludwig, C. Medard, G. Meng, C. Wilhelm, M. Wilhelm, S.
Leitung/Koordination: Küster, B.
Mo, 09:00–16:00, EG L 12
Mo, 09:00–16:00, EG L 12
Do, 09:00–16:00, EG L 12
SS 2020 Proteomics Practical Course Ludwig, C. Medard, G. Meng, C. Wilhelm, M. Wilhelm, S.
Leitung/Koordination: Küster, B.
Do, 09:00–17:00, EG L 12
Fr, 09:00–17:00, EG L 12
WS 2019/20 Intensivkurs Proteomics Ludwig, C. Meng, C. Wilhelm, M. Wilhelm, S.
Leitung/Koordination: Küster, B.
Mo, 09:00–16:00, EG L 12
SS 2019 Proteomics Practical Course Ludwig, C. Medard, G. Meng, C. Wilhelm, M. Wilhelm, S.
Leitung/Koordination: Küster, B.
Mo, 09:00–16:00, EG L 12
SS 2018 Proteomics Practical Course
WS 2017/8 Intensivkurs Proteomics
SS 2017 Proteomics Practical Course
WS 2016/7 Intensivkurs Proteomics
SS 2016 Proteomics Practical Course
WS 2015/6 Intensivkurs Proteomics
SS 2015 Proteomics Practical Course
WS 2014/5 Intensivkurs Proteomics
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