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Proteomics: Analytische Grundlagen und Biomedizinische Anwendungen
Proteomics: Analytical Basics and Biomedical Applications

Modul WZ2439

Dieses Modul wird durch Lehrstuhl für Proteomik und Bioanalytik (Prof. Küster) bereitgestellt.

Diese Modulbeschreibung enthält neben den eigentlichen Beschreibungen der Inhalte, Lernergebnisse, Lehr- und Lernmethoden und Prüfungsformen auch Verweise auf die aktuellen Lehrveranstaltungen und Termine für die Modulprüfung in den jeweiligen Abschnitten.

Modulversion vom SS 2012 (aktuell)

Von dieser Modulbeschreibung gibt es historische Versionen. Eine Modulbeschreibung ist immer so lange gültig, bis sie von einer neuen abgelöst wird.

verfügbare Modulversionen
SS 2012WS 2011/2

Basisdaten

WZ2439 ist ein Semestermodul in Deutsch oder Englisch auf Master-Niveau das in jedem Semester angeboten wird.

Das Modul ist Bestandteil der folgenden Kataloge in den Studienangeboten der Physik.

  • Fokussierungsrichtung Biosensorik im M.Sc. Biomedical Engineering and Medical Physics
GesamtaufwandPräsenzveranstaltungenUmfang (ECTS)
180 h 75 h 6 CP

Inhalte, Lernergebnisse und Voraussetzungen

Inhalt

In der Vorlesung werden die theoretischen Grundlagen der Proteomanalytik gelegt.
Diese umfassen die Theorie der Chromatographie und der Massenspektrometrie sowie
die wichtigsten Arten chromatographischer Trennungen und massenspektrometrischer
Peptidsequenzierung und Quantifizierung.
Die Übungsthemen erfassen insbesondere: Sequenzierung von Peptiden mittels LC-M/MS,
Spektreninterpretation, Datenbanksuchen und Internetrecherchen.
Der Inhalt wird laufend aktualisiert, entsprechend der aktuellsten Entwicklungen aus dem Bereich der
Proteomforschung.

Lernergebnisse

Nach Teilnahme an der Modulveranstaltung kennen die Studierenden die methodischen Grundlagen der Proteomik (z.B. Probenaufbereitung, Protein- und Peptidfraktionierung, Massenspektrometrie, Proteinidentifikation und –quantifizierung, Datenanalyse) und verstehen die theoretischen Hintergründe sowie den Anwendungsbereich der jeweiligen Methoden. Sie sind in der Lage, überwiegend selbständig mit den Methoden der Proteomik (z.B. verschiedene chromatographische Methoden, massenspektrometrische Methoden, Quantifizierungsstrategien, Datenqualitätsprüfung und -auswertung) zu arbeiten und Antworten auf biologische oder medizinische Fragestellungen zu entwickeln (z.B. Analyse von posttranslationalen Modifikationen, Identifikation von Biomarkern, Analyse von Protein-Protein und Protein-Wirkstoff Interaktionen), um damit beispielsweise den Wirkmechanismus von Therapeutika im humanen Proteom aufzuklären. Die Studierenden können Experimente zur quantitativen und qualitativen Erfassung des Proteoms konzipieren und die Ergebnisse vor dem experimentellen Hintergrund bewerten. Sie können wissenschaftliche Fragestellungen präzise zusammenfassen, darstellen und erklären.

Voraussetzungen

Erfolgter BSc Abschluss

Lehrveranstaltungen, Lern- und Lehrmethoden und Literaturhinweise

Lehrveranstaltungen und Termine

Lern- und Lehrmethoden

Lehrtechnik: Vorlesung, Übung und Praktikum;
Lernaktivitäten: Bearbeiten von proteomanalytischen Fragestellungen und deren Lösungsfindung;
Üben von labortechnischen Fertigkeiten; Zusammenarbeit in Zweiergruppen; Konstruktives
Diskutieren und Kritisieren eigener Experimente; Lehrmethode: Fragend-entwickelnde Methode
In den Übungen (Intensivkurs) werden die in der Vorlesung erarbeiteten Inhalte in die Praxis
umgesetzt. Die Übung soll praxisorientierte Einblicke zur Lösung proteomanalytischer Fragestellungen
geben.
Ein wesentlicher Aspekt der Übung besteht darin, dass die Studierenden u.a. ausgehend von
vorgegebenen Fragen 7-8 Experimente in Eigenregie konzipieren, durchführen und bewerten. Dabei
gewinnen Sie einen Eindruck für die Komplexität auch einfach erscheinender Versuchsprotokolle.
Ausschließlich in den Übungen haben die Studierenden die Möglichkeit zum Arbeiten mit spezifischer
Software aus dem Bereich der Proteomik und damit zur Erweiterung ihrer fachspezifischen
Kompetenz.

Medienformen

Übungsblätter, Tafelarbeit, PowerPoint

Literatur

aktuelle Literatur zu den spezifischen Themen; überwiegend von Studierenden zu recherchieren

Modulprüfung

Beschreibung der Prüfungs- und Studienleistungen

Prüfungsart und -dauer (in min.): Klausur 90 min.
Die Prüfungsleistung für das Modul wird durch eine Klausur und eine Präsentation nachgewiesen.
In der Klausur wird geprüft, dass die Studierenden die theoretischen Grundlagen beherrschen und in
der Lage sind, Antworten auf biologische Fragestellungen auf Basis des Methodenspektrums der
Proteomik zu entwickeln und die Ergebnisse vor dem experimentellen Hintergrund zu werten.
Die Präsentation wird aus einer der Übungsaufgaben in Gruppen mit 2-3 Teilnehmern entwickelt,
wobei die einzelnen Gruppen unterschiedliche Aufgaben erhalten. Jede Gruppe stellt ihre im Kurs erarbeiteten Lösungswege für die gestellte
Aufgabe und die zugehörigen Resultate vor. Dabei zeigen die Studierenden, dass Sie in der Lage
sind, wesentliche Aspekte ihrer neuerworbenen Fertigkeiten und Strategien strukturiert und
reflektiert darzustellen. Sie müssen die Anwendung der notwendigen Methoden kurz erläutern und im
Kontext der Fragestellung diskutieren. In die Bewertung fließen neben dem Inhalt auch formale
Aspekte der Präsentation ein.
Die Klausur und die Präsentation werden im Verhältnis 3 (Klausur) zu 2 (Präsentation) gewichtet. Das
Modul ist bestanden, wenn das gewichtete Mittel besser als 4,09 ist.

Wiederholbarkeit

Eine Wiederholungsmöglichkeit wird im Folgesemester angeboten.

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