Molekulardynamik
Prof. Martin Zacharias
Forschungsgebiet
Die Funktion von Proteinen und Nukleinsäuren in lebenden Zellen wird durch ihre molekulare Dynamik bestimmt. Am Lehrstuhl „Molekulardynamik“ werden Computersimulationsmethoden eingesetzt, um die Struktur, Funktion und Dynamik von Biomolekülen zu untersuchen. Zu unseren Zielen zählt dabei ein genaueres Verständnis von Strukturbildungsprozessen und die Entschlüsselung des Mechanismus der Assoziation von Biomolekülen. Moleküldynamiksimulationen basierend auf einem klassischen Kraftfeld bilden unsere wichtigste Methode, um die Molekülbewegung in atomarem Detail zu verfolgen. Die Simulationen erlauben es uns, thermodynamische und kinetische Moleküleigenschaften mit Methoden der statistischen Mechanik zu analysieren. Wir entwickeln darüber hinaus auch Verfahren, um die Bindung von Liganden an Biomoleküle vorherzusagen.
Adresse/Kontakt
Ernst-Otto-Fischer-Straße 8/I
85748 Garching b. München
+49 89 289 12393
Fax: +49 89 289 12444
Mitarbeiterinnen und Mitarbeiter der Arbeitsgruppe
Professor
Photo | Akad. Grad | Vorname | Nachname | Raum | Telefon | |
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Prof. Dr. | Martin | Zacharias | 046 | +49 89 289-12335 |
Sekretariat
Photo | Akad. Grad | Vorname | Nachname | Raum | Telefon | |
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Sonja | Ortner | 047 | +49 89 289-12393 |
Wissenschaftlerinnen und Wissenschaftler
Photo | Akad. Grad | Vorname | Nachname | Raum | Telefon | |
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M.Sc. | Shu-Yu | Chen | 042 | +49 89 289-12564 | ||
M.Sc. | Maximilian | Kienlein | 044 | +49 89 289-12730 | ||
Brianda | Lopez Santini | 045 | +49 89 289-12731 | |||
Dr. | Patrick | Quoika | 048 | +49 89 289-13766 | ||
Dr. | Maria | Reif | 045 | +49 89 289-12731 | ||
M.Sc. | Carlos Christian | Sustay Martinez | 040 | +49 89 289-51612 | ||
M.Sc. | Luis | Vollmers | 044 | +49 89 289-12730 | ||
M.Sc. | Paul | Westphälinger | 044 | +49 89 289-12730 | ||
Dr. | Gabriel | Zoldak | 130 | – | ||
M.Sc. | Richard | Zschau | 042 | +49 89 289-12564 |
Studierende
Photo | Akad. Grad | Vorname | Nachname | Raum | Telefon | |
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B.Sc. | Maximilian | Block | – | – | ||
Asha | Knipp | – | – | |||
B.Sc. | Pawel | Korzeb | – | – | ||
B.Sc. | Mira Tanja | Mahlein | – | – | ||
B.Sc. | Yasmin | Saremi Nanji | – | – | ||
Luis Jakob | Walter | – | – | |||
Ziyi | Wang | – | – | |||
Andere Mitarbeiterinnen und Mitarbeiter
Photo | Akad. Grad | Vorname | Nachname | Raum | Telefon | |
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Dr. | Jonathan | Coles | 048 | – | ||
Susmita | De | – | – | |||
M.Sc. | Christina | Frost | – | – | ||
Margrethe | Gaardlos | – | – | |||
Ameya | Harmalkar | – | – | |||
M.Sc. | Julian | Hartmann | 701 | – | ||
Dr. | Manuel | Hitzenberger | 048 | +49 89 289-13766 | ||
Dr. | Korbinian | Liebl | – | +49 89 289-13697 | ||
Anshuman J. | Mahapatra | – | – | |||
M.Sc. | Danial | Pour Jafar Dehkordi | 059 | – | ||
B.Sc. | Arrien Symon | Rauh | – | – | ||
Jose | Roldan | – | – | |||
Prof. Dr. | Philipp | Scherer | 073 | – | ||
Neelanjana | Sengupta | – | – | |||
Till | Siebenmorgen | 059 | – |
Lehrangebot der Arbeitsgruppe
Lehrveranstaltungen mit Beteiligung der Arbeitsgruppe
Abgeschlossene und laufende Abschlussarbeiten an der Arbeitsgruppe
- Harmonic nearest-neighbour modelling of DNA flexibility
- Abschlussarbeit im Bachelorstudiengang Physik
- Themensteller(in): Martin Zacharias
- Simulation of ligand binding and global adaptation of the ABC importer GlnPQ's substrate binding domain 2
- Abschlussarbeit im Masterstudiengang Physics (Applied and Engineering Physics)
- Themensteller(in): Martin Zacharias
- Investigation of the Mechanism of dsRNA Protein Binding Using Molecular Dynamics Simulations
- Abschlussarbeit im Bachelorstudiengang Physik
- Themensteller(in): Martin Zacharias
- Investigation of the Mechanism of Protein-DNA Binding by Molecular Dynamics Simulations
- Abschlussarbeit im Bachelorstudiengang Physik
- Themensteller(in): Martin Zacharias
- Untersuchung des Mechanismus der Protein-DNA-Bindung durch Molekulardynamik-Simulationen
- Abschlussarbeit im Bachelorstudiengang Physik
- Themensteller(in): Martin Zacharias