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Mit 1.10.2022 ist die Fakultät für Physik in der TUM School of Natural Sciences mit der Webseite https://www.nat.tum.de/ aufgegangen. Unter Umstellung der bisherigen Webauftritte finden Sie weitere Informationen.

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Molekulardynamik

Prof. Martin Zacharias

Forschungsgebiet

Die Funktion von Proteinen und Nukleinsäuren in lebenden Zellen wird durch ihre molekulare Dynamik bestimmt. Am Lehrstuhl „Molekulardynamik“ werden Computersimulationsmethoden eingesetzt, um die Struktur, Funktion und Dynamik von Biomolekülen zu untersuchen. Zu unseren Zielen zählt dabei ein genaueres Verständnis von Strukturbildungsprozessen und die Entschlüsselung des Mechanismus der Assoziation von Biomolekülen. Moleküldynamiksimulationen basierend auf einem klassischen Kraftfeld bilden unsere wichtigste Methode, um die Molekülbewegung in atomarem Detail zu verfolgen. Die Simulationen erlauben es uns, thermodynamische und kinetische Moleküleigenschaften mit Methoden der statistischen Mechanik zu analysieren. Wir entwickeln darüber hinaus auch Verfahren, um die Bindung von Liganden an Biomoleküle vorherzusagen.

Adresse/Kontakt

Ernst-Otto-Fischer-Straße 8/I
85748 Garching b. München
+49 89 289 12393
Fax: +49 89 289 12444

Mitarbeiterinnen und Mitarbeiter der Arbeitsgruppe

Professor

Sekretariat

Wissenschaftlerinnen und Wissenschaftler

Studierende

Andere Mitarbeiterinnen und Mitarbeiter

Lehrangebot der Arbeitsgruppe

Lehrveranstaltungen mit Beteiligung der Arbeitsgruppe

Titel und Modulzuordnung
ArtSWSDozent(en)Termine
Elementary Processes in Molecular Systems
Zuordnung zu Modulen:
VO 2 Scherer, P. Do, 12:00–14:00, PH 2271
Molekulardynamik-Simulationen: von den Grundlagen zu Anwendungen
Zuordnung zu Modulen:
VO 2 Zacharias, M. Mo, 10:00–12:00, PH II 227
Bachelorseminar zur Biophysik
Zuordnung zu Modulen:
PS 2 Bausch, A. Zacharias, M.
Seminar zu aktuellen Themen der molekularen Biophysik
Zuordnung zu Modulen:
PS 2 Zacharias, M. Mi, 14:00–16:00, PH 2074
Übung zu Elementare Prozesse in molekularen Systemen
Zuordnung zu Modulen:
UE 2 Scherer, P. Termine in Gruppen
Übung zu Molekulardynamik-Simulationen: von den Grundlagen zu Anwendungen
Zuordnung zu Modulen:
UE 2 Reif, M.
Leitung/Koordination: Zacharias, M.
Termine in Gruppen
Biomolecular Systems
Zuordnung zu Modulen:
SE 2 Gerland, U. Simmel, F. Zacharias, M. Do, 12:00–13:30, PH 3343
FOPRA-Versuch 74: Molekulardynamik
aktuelle Informationen
Zuordnung zu Modulen:
PR 1 Zacharias, M.
Mitwirkende: Frost, C.Westphälinger, P.
Mentoren informieren zur Schwerpunktwahl im Bachelorstudiengang Physik (Biophysik [BIO])
aktuelle Informationen
Zuordnung zu Modulen:
OV 0.1 Bausch, A. Zacharias, M. einzelne oder verschobene Termine
Mentorenprogramm im Bachelorstudiengang Physik (Professor[inn]en K–Z)
Zuordnung zu Modulen:
KO 0.2 Kaiser, N. Kienberger, R. Knap, M. Krischer, K. Märkisch, B. … (insgesamt 25)
Leitung/Koordination: Höffer von Loewenfeld, P.
Termine in Gruppen

Abgeschlossene und laufende Abschlussarbeiten an der Arbeitsgruppe

Solvation free energy of protein surface side chains using an explicit solvent model
Abschlussarbeit im Bachelorstudiengang Physik
Themensteller(in): Martin Zacharias
Studying ligand binding to the DNA minor groove using Molecular Dynamics simulations
Abschlussarbeit im Bachelorstudiengang Physik
Themensteller(in): Martin Zacharias
Studying Mechanical Stability of Amyloid Fibrils with Molecular Dynamics
Abschlussarbeit im Bachelorstudiengang Physik
Themensteller(in): Martin Zacharias
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