Physical Biology of the Cell 1
Module PH2013
Module version of WS 2010/1
There are historic module descriptions of this module. A module description is valid until replaced by a newer one.
Whether the module’s courses are offered during a specific semester is listed in the section Courses, Learning and Teaching Methods and Literature below.
| available module versions | ||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| WS 2022/3 | WS 2021/2 | WS 2020/1 | WS 2019/20 | WS 2018/9 | WS 2017/8 | WS 2016/7 | WS 2015/6 | WS 2010/1 |
Basic Information
PH2013 is a semester module in German language at Master’s level which is offered in winter semester.
This module description is valid to SS 2015.
If not stated otherwise for export to a non-physics program the student workload is given in the following table.
| Total workload | Contact hours | Credits (ECTS) |
|---|---|---|
| 150 h | 75 h | 5 CP |
Responsible coordinator of the module PH2013 in the version of WS 2010/1 was Hendrik Dietz.
Content, Learning Outcome and Preconditions
Content
- Einführung: Was sind biologische Makromoleküle?
- Makromolekulare Längen-, Zeit-, Kraft-, und Energieskalen
- Makromolekulare Fluidmechanik
- Makromolekular-Diffusion
- Makromolekulare Assoziation und Dissoziation (frei/in Potentialen)
- Dynamik/Gleichgewicht von Zwei-Zustandssystemen
- Dynamik/Gleichgewicht bimolekularer Reaktionen
- Enzymkinetik
- Dynamik molekularer Motoren
- Biopolymer-Mechanik
- Makromoleküle unter Kraftwirkung
- Makromolekulare Regelkreise (Gen-Regulation, Signalverarbeitung)
Learning Outcome
Nach erfolgreicher Teilnahme an diesem Modul ist der/die Student(in) in der Lage:
- Biologische Makromolekülklassen und die für sie relevante physikalische Umgebung (Zeit-, Längen-, Kraftskalen etc) zu beschreiben.
- Wesentliche dynamische und stationäre Eigenschaften von makromolekularen Zustandsänderungen sowie von bimolekularen Reaktionen, auch in Abhängigkeit von zusätzlichen Einflüssen wie z.B wirkenden Kräften zu erklären.
- Begriffe wie Entropieelastizität, Dissoziationskonstante, Übergangszustand, Übergangsrate zu verstehen.
- Modelle zur physikalischen Beschreibung makromolekularer Regelkreise (Gen-Repression/regulierte Rekrutierung, Adaption) anzugeben und zu erklären.
Preconditions
Keine Vorkenntnisse nötig, die über die Zulassungsvoraussetzungen zum Masterstudium hinausgehen.
Courses, Learning and Teaching Methods and Literature
Learning and Teaching Methods
Vortrag, Beamerpräsentation, Tafelarbeit, Übungen in Einzel- und Gruppenarbeit
Media
Übungsblätter
Literature
- J. Howard: "Mechanics of Motor Proteins and the Cytoskeleton"
- P. Nelson: "Biological Physics: Energy, Information, Life"
- R. Philipps: "Physical Biology"
- U. Alon: "Introduction to Systems Biology"
- M. Ptashne: "Genes and Signals"
- L. Stryer: "Biochemistry"
- B. Alberts: "The Cell"
- E. Wilson: "The future of life"
Module Exam
Description of exams and course work
In an oral exam the learning outcome is tested using comprehension questions and sample problems.
In accordance with §12 (8) APSO the exam can be done as a written test. In this case the time duration is 60 minutes.
Remarks on associated module exams
The exam for this module can be taken together with the exam to the associated follow-up module PH2014: Biophysik in der Zelle 2 / Physical Biology of the Cell 2 after the follwoing semester. In this case you need to register for both exams in the following semester.
Exam Repetition
The exam may be repeated at the end of the semester. There is a possibility to take the exam in the following semester.